企業所得稅匯算清繳是一項復雜的工作。近年來，隨著企業所得稅政策的不斷完善和企業財務會計制度的調整變化，加上原申報表本身在體系結構的設計上也存在一定的缺陷，使得原申報表不能全面體現和貫徹企業所得稅政策及征管的要求，因此國家稅務總局《關于修訂企業所得稅納稅申報表的通知》（國稅發[2006]56號）進一步規范了納稅申報，但在實務工作過程中存在以下幾個政策疑問。
一、資助非關聯的科研機構和高等學校的研究開發經費支出
財政部、國家稅務總局《關于非營利性科研機構稅收政策的通知》（財稅[2001]5號)規定，自2001年1月1日起，對社會力量，包括企業單位、事業單位、社會團體、個人和個體工商戶，資助非關聯的科研機構和高等學校研究開發新產品、新技術、新工藝所發生的研究開發經費，經主管稅務機關審核確定，其資助支出可以全額在當年度應納稅所得額中扣除。當年度應納稅所得額不足抵扣的，不得結轉抵扣。
對不符合條件的“納稅人資助非關聯的科研機構和高等學校研究開發新產品、新技術、新工藝所發生的研究開發經費”不得稅前扣除。其中：不符合條件是指：1.存在關聯關系：隸屬關系、投資關系、雖不存在隸屬關系（投資關系）但其研究成果只提供給資助企業（有排他性）；2.有關憑證的合法性、真實性；3.資助款是否用于該機構以及是否用于新產品、新技術、新工藝的研究開發。
疑問：在納稅申報表中“公益、救濟性捐贈”項目上未涉及，納稅調整減少項目上也未涉及。
處理方法一：從性質上，應比照全額扣除的公益、救濟性捐贈處理，對不符合條件的視同贊助支出。
處理方法二：經主管稅務機關審核后，作為納稅調整減少項目金額。
二、三項所得（收入）分五年納稅問題
納稅人在一個納稅年度發生的非貨幣性資產投資轉讓所得、債務重組所得、捐贈收入，占應納稅所得50%及以上的，并入一個納稅年度繳稅確有困難，可以在不超過5年的期間均勻計入各年度的應納稅所得。
經納稅調整后，若納稅人當年發生虧損，則可以認定上述所得（收入）超過當年應納稅所得的50%；若納稅人當年有應納稅所得，則以上述所得（收入）與當年應納稅所得之比確定。當年實現應納稅所得是指，上述所得（收入）未計入當年應納稅所得額的應納稅所得。實際中，當上述比率等于或大于50%時，納稅人一般會選擇在五年期間均勻計入各年度的應納稅所得。
疑問：對“非貨幣性資產投資轉讓所得”、“債務重組所得”，在附表一14行“處置非貨幣性資產視同銷售的收入”、附表二15行“處置非貨幣性資產視同銷售成本”相應項目填列；“接受捐贈收入”在附表一27行“接受捐贈的資產”項目填列，但看不出是否包括分五年并入應納稅所得額的情形。
處理方法一：進一步明確。
處理方法二：對以前年度的三項所得需并入納稅年度的應納稅所得額的作為“納稅調整增加項目明細表”的“以前年度非貨幣性資產投資轉讓所得、債務重組所得、捐贈收入的并入額”項目單獨列示。
三、“納稅調整后所得”與“調整后虧損或所得額”
主表16行“納稅調整后所得”，如為負數，就是納稅人當年可申報向以后年度結轉的虧損額。
企業所得稅后續管理附表1《企業稅前彌補以前年度虧損情況明細表》中“調整后虧損或所得額”填寫經稅務機關核實、調整后的數額，虧損額為“－”負數，應納稅所得額為“+”數。
建議：企業所得稅后續管理附表1《企業稅前彌補以前年度虧損情況明細表》中“調整后虧損或所得額”數據來源主表16行“納稅調整后所得”。
（詳文見《商業會計》2008年1月 第2期）
