“兩稅合并”是我國企業所得稅法改革的必然趨勢，新的企業所得稅法(草案)提出了“四個統一”，即統一稅法；統一企業所得稅稅率；統一稅前扣除辦法和標準；統一稅收優惠政策。本文試對企業所得稅合并前后在稅率、稅基、稅收優惠、稅收管理等方面的差異進行比較分析，供參考。
一、稅率方面的差異
按規定，內資企業適用33%的所得稅稅率；對年度應稅所得額在3萬元以下（含3萬元）的企業，按18%征收企業所得稅；對年應稅所得額3至10萬元（含10萬元）的企業，按27%征稅，即內資企業實際適用18%、27%、33%三檔稅率。
外商投資企業和外國企業的企業所得稅稅率為30%，另征收3%的地方所得稅，總負擔率為33%。
兩稅合并，新法草案將內外資企業的稅率統一為25%，對符合條件的微利企業，將實行20%的照顧性稅率。
二 、稅基方面的差異
（一）稅前扣除工資薪金與福利費
兩稅合并，在工資支出上，改變了目前對內資企業實行的計稅工資制扣除，而改為按企業和單位實際發放的工資據實扣除。
（二）稅前扣除公益救濟性捐贈
兩稅合并，在公益性捐贈方面，草案規定，企業向民政、教科文衛、環保、社會公共和福利事業的捐贈，在年度利潤總額10%以內的部分，準予扣除。
（三）稅前扣除廣告費
兩稅合并，在廣告費方面，支出不超過當年銷售收入15%的部分，可據實扣除，超過比例的部分可結轉到以后年度扣除。
（四）稅前扣除研發費
兩稅合并，在研發費方面，不同的地方是可按實際發生額的150%抵扣當年的應納稅所得額。
三、稅收優惠方面的差異
內資企業的優惠政策適用范圍較窄，主要有第三產業，利用“三廢”企業、勞服企業、校辦工廠、福利企業等，外資企業的適用范圍較寬，主要有：生產性企業、先進技術企業、產品出口企業，以及從事能源、交通、港口建設等企業，內資企業減免優惠政策時間較短，一般為1-3年，而外資企業減免優惠時間較長，一般為5年或5年以上。
兩稅合并后，各種稅收優惠都進行整合：
一是“擴大”。
二是“保留”。對港口、碼頭、機場、鐵路、公路、電力、水利等基礎設施投資，以及對農業、林業、牧業和漁業的稅收優惠政策將予以保留。
三是“替代”。
四是“過渡”。
四、稅收征管方面的差異
草案對企業所得稅的征收管理作了補充規定，即對在中國境內設立不具有法人資格營業機構的居民企業，應當匯總計算、繳納企業所得稅。草案借鑒國際慣例，對防止關聯方轉讓定價作了明確規定，同時增加了一般反避稅、防范資本弱化、防范避稅地避稅、核定程序和對補征稅款加收滯納金等條款
