代扣個人所得稅的核算，在新會計準則下改變了相關的會計科目，由以前的“應付工資”改變為“應付職工薪酬”、“應交稅金—應交個人所得稅”改變為“應交稅費—應交個人所得稅”；新稅法對個人所得稅的工資薪金所得減除費用標準自2008年3月1日起由1600元調整為2000元（國稅發[2008]20號），個人所得稅實行源泉控制，即由支付人履行代扣代繳的義務，按照《個人所得稅法》規定，扣繳義務人向個人支付下列所得，應代扣代繳個人所得稅：工資薪金所得、對企事業單位的承包經營承租經營所得、勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得、利息股息紅利所得、財產租賃所得、財產轉讓所得、偶然所得、經國務院財政部門確定征稅的其他所得等。下面介紹企業經常出現的幾種代扣代繳個人稅款及賬務處理。
一、工資薪金所得的代扣個人所得稅
工資薪金所得計算個人所得稅時采用5%~45%的九級超額累進稅率，企業為職工代扣代繳個人所得稅有兩種情況：
（一）稅款個人負擔，企業作為個人所得稅的扣繳義務人，應按規定扣繳該職工應繳納的個人所得稅。代扣個人所得稅時，借記：“應付職工薪酬”科目，貸記：“應交稅費—應交個人所得稅”科目。
【例1】某企業職工王某，2008年6月份月工資是2500元，獎金1200元，則該雇員6月份應繳納個人所得稅計算如下：應納稅所得額=2500＋1200－2000=1700（元），因應納稅所得額在500~2000，適用10%的稅率、速算扣除數為25，應納稅額=1700×10％－25=145（元）。
企業應做會計分錄如下：
①支付工資時，計算應代扣代繳個人所得稅額
借：應付職工薪酬 145
貸：應交稅費—應交個人所得稅 145
②繳納個人所得稅時
借：應交稅費—應交個人所得稅 145
貸：銀行存款 145
（二）稅款由企業負擔，一是按照合同或者協議規定，納稅義務人應納的個人所得稅全部或部分由企業負擔。這種情況通常是企業的自愿行為。二是因企業未履行扣繳義務，個人所得稅由企業補繳。這種情況是稅法對未履行扣繳義務的一種“處罰”。企業除了補繳稅款外，還需按規定繳納一定數量的滯納金和罰款。
由于個人所得稅是對取得應稅收入的個人征收的一種稅，其稅款本應由個人負擔。企業代納稅人負擔的稅款屬于與企業經營活動無關的支出，應記入‘利潤分配“或”營業外支出“科目。與之相適應，企業代負的個人所得稅也不得在企業所得稅前扣除，在年終申報企業所得稅時，應全額調增應納所得稅。
二、承包承租所得的代扣個人所得稅
承包經營、承租經營所得適用5%-35%的五級超額累進稅率，是以每一納稅年度扣除必要費用進行計算的，由于平時的工資已經發放，年終匯算清繳時，可從其應分得的利潤中，將應繳的個人所得稅一并代扣。承包經營、承租經營所得應納代扣代繳個人所得稅的計算，同工資、薪金所得代扣代繳所得稅的計算一樣。應先將納稅人取得的不含稅收入核算為應納稅所得，然后再計算其應納稅額，應當在取得每次收入的7日內預繳稅款，年度終了后3個月內匯算清繳，多退少補。
支付給個人承包、承租收入的單位為扣繳義務人，應代扣代繳個人所得稅。扣繳義務人應作如下會計處理。
①支付承包所得并代扣個人所得稅時：
借：應付利潤（其他應付款）
貸：應交稅費—應交個人所得稅
②代繳稅金時：
借：應交稅費—應交個人所得稅
貸：銀行存款（現金）
三、勞務報酬等所得的代扣個人所得稅
支付勞務報酬、稿酬、特許權使用費、財產租賃，財產轉讓及利息、股息、紅利等稅法規定所得的企業、事業單位，應按稅法規定代扣代繳個人所得稅，采用比例稅率。其中對勞務報酬所得一次收入畸高的（超過20000元），規定在適用20%稅率基礎上，實行加成征收，超過20000~50000的部分適用30%，超過50000元的部分適用40%。
【例2】某新辦公司因業務需要，聘請設計師張某對該公司進行裝修設計，一次性支付勞務報酬費用110000元，則該設計師張某應繳納個人所得稅計算如下：應納稅所得額=110000×（1－20％）=88000（元），應納稅額=20000×20％＋（50000－20000）×30％＋（88000－50000）×40％ =4000＋9000＋15200=28200（元）
該公司應做會計分錄如下：
① 支付工資，計算出應代扣代繳個人所得稅稅款時
借：在建工程—裝飾工程（待攤費用）110000
貸：銀行存款81800
應交稅費—應交個人所得稅 28200
②繳納個人所得稅時
借：應交稅費—應交個人所得稅28200
貸：銀行存款 28200
