(一)按照“先進、適用、節約”的原則，選擇成熟的會計軟件
中小企業由于其自身管理的特點 ，在選擇會計軟件時，一定要考慮自身現行的財務流程以及本企業的特點，不必盲目求大求洋。只有適合自己企業的，才是最好的。不同的會計軟件，由于開發思想不同，其所表現的會計思想也不一樣，再加上開發人員的偏好，往往導致會計軟件的處理流程與企業實際的財務流程有很大的差異。而即使是同一企業，在不同的階段，其財務流程也有不同的特點。企業選用的會計軟件處理流程應該可以適應這些變化，否則企業將花費相當大的成本進行流程改變。
(二) 會計軟件的處理流程是否適應企業現行的財務流程
不同的會計軟件由于其開發思想不同，其所表現的會計思想也不一樣，再加上開發公司的背景差異和開發人員的偏好，往往導致會計軟件的處理流程與企業實際的財務流程有很大差異。而另一個方面，不同企業的財務流程也各不相同，即使同一企業，在不同的階段，其財務流程也有其不同的特點。企業選用的會計軟件處理流程應盡量符合企業的財務流程，當企業財務流程發生變化后，會計軟件的處理流程也應該可以適應這些變化，否則企業將花費相當大的成本進行流程改造。在選用會計軟件時，企業應根據現行的財務流程，初步規劃實行電算化后的財務流程，并以此選擇相應的軟件。如果選擇通用性的會計軟件，雖然其具有的功能模塊基本趨于穩定，其處理流程也一般遵循一定的規律，但各個會計軟件為突出其特色，往往加強某些模塊的功能，或提供一些輔助性的功能，這些特色可使軟件在很大程度上與企業現行的財務流程相適應，因此選用會計軟件也應事先充分了解這些產品特色。
(三) 要考慮會計軟件所用平臺是否與企業平臺一致
目前，國內企業的操作平臺大多是WINDOWS，絕大多數會計軟件也是基于WINDOWS開發的。企業應盡量操作平臺一致，以免出現不必要的麻煩。如果企業單純為了適應所選擇的會計軟件而升級其系統平臺，可能花費的成本很大。有些企業可能處于其個別的考慮而采用其他平臺，如UNIX，LINUX等，這就要考慮其平臺的兼容性。如果操作平臺不兼容，可以選擇一些采用與平臺無關的語言開發的軟件。即使平臺類型一致也要考慮版本的兼容性不同版本下開發的會計軟件應用時可能存在這樣或那樣的問題，即使軟件廠商打出許多補丁，也往往并不能令人滿意。
(四) 會計軟件所應用的領域與企業所處的領域是否一致
如果會計軟件所應用的領域與企業所處領域不一致 ，則企業勢必要耗費周折對軟件進行重新定義。否則，軟件所具有的功能企業用不上，而企業需要的功能軟件又沒有。會計軟件不能發揮它的長處，嚴重影響了執行效率，增加了復雜性，使得企業的數據操作很容易出現錯誤。因此，軟件和企業的領域一致性至關重要。如果企業處在典型的行業中，那么毫無疑問，行業會計軟件應該是他們的最好選擇。但對大多數中小企業而言，行業會計軟件因分工太細、體系龐大而代價高昂，一套典型的行業會計軟件從實施到運行往往又需要一定的時間，這些都是中小企業所不能忍受的。這時通用軟件是最好的選擇，雖然一般情況下它們的行業特色并不明顯，但在眾多的會計軟件中總有一些軟件，由于軟件公司的原因或者是軟件開發者自身的原因，往往帶有某些行業特色，這些軟件對某些領域企業的需要考慮的比較多，更能適應企業的特點，企業應充分關注這一點。選擇適合企業所處領域的會計軟件應用起來必能收到事半功倍的效果。
(五) 要考慮會計軟件所選用的數據庫是否與企業選型一致
現在，市場上的數據庫非常多，類型與特點也不一樣有處理大型數據的，有處理小型數據的有價格不菲的 ，也有完全免費的。企業選擇數據庫應充分考慮其信息系統要求，如果會計軟件數據庫與其不一致，不但增加了企業成本，也為信息的搜集、分配帶來困難。如果財務信息不能直接為企業的其他系統所用，則很容易形成信息孤島，或者要大費周折進行數據轉換、因此，會計軟件所用數據庫應盡量與企業選用數據庫一致。
(六) 會計軟件是否預留相關接口
作為任何軟件來說 ，不能不考慮其開放性和前瞻性。如果軟件沒有任何接口或升級的可能性，必然為以后的應用帶來困難。有相關接口的軟件能夠很容易地將數據轉換為其他格式，甚至其他會計軟件格式。如果在一個企業集團內部各個單位應用了不同的會計軟件，在各個單位間傳遞數據時，接口無疑非常重要。軟件接口也為以后操作平臺的升級提供方便，會計軟件很可能會和新的操作系統產生沖突。目前，國家及有關地方都規定了一些會計標準數據格式，采用標準數據格式的會計軟件可以很容易地將會計數據進行導入和導出。但大多數的會計軟件從市場角度考慮，并沒有采用標準數據格式。企業在選擇會計軟件時，應該考慮到這一點。
(七) 會計軟件的操作設計是否適應企業的特點
基于不同會計思想開發的會計軟件在操作設計上有很大差異，這一點從國內兩大會計軟件領導廠商用友跟金碟的對比中就可以看得出。不同企業的財務核算有其各自的特點，企業財務部門在長期工作中也逐漸形成了自己的習慣，為避免使用軟件后出現不適應的情況， 企業應了解會計軟件的操作設計與企業的操作習慣是否一致。比如報表的格式，許多企業出于其特殊要求可能需要許多非標準格式的報表，某些會計軟件可能考慮到了這一點，設計了豐富詳盡的自定義報表契合企業的要求。而某些軟件可能在操作方面有許多創新性的設計，從而大大方便企業會計人員的操作，企業在選擇的過程中應考慮到這些因素。
(八) 要考慮會計軟件的開放性和前瞻性
會計軟件是否預留相關接口，這是一個不容忽視的問題如果會計軟件沒有任何接口或升級的可能性，必然為以后的應用帶來困難。有相關接口的軟件能夠很容易地將數據轉換為其他格式， 甚至其他會計軟件格式如果在一個集團內部各個單位應用了不同的會計軟件，在各個單位間傳遞數據時，接口無疑非常重要。會計軟件接口也為以后操作平臺的升級提供方便。會計軟件很可能和新的操作系統產生沖突，目前，國家及有關地方都規定了一些會計標準數據格式，采用標準數據格式的會計軟件可以很容易地將企業會計數據進行導入和導出。但是大多數的會汁軟件從市場角度考慮并沒有采用標準數據格式。企業在選擇會計軟件時，應該考慮這一點。
以上八點是企業在選擇會計軟件時必須要考慮到的，在選擇會計軟件時， 還有以下幾點不容忽視：
一是會計軟件的性能是否安全可靠：會計數據是企業最重要的信息之一，因此安全可靠性至關重要。所謂的安全可靠指會計軟件防止會計信息被泄漏和破壞的能力，會計軟件防錯和糾錯的能力。這包括幾個方面 ①在計算機出現硬性故障時數據的安全性，如斷電、硬件損壞、病毒等 ②操作權限的控制 ③數據庫的安全性。對于一個非主流會計軟件，企業在購買前不可能了解這些 ，可以以該軟件是否通過軟件測評作為初步的標準。順利通過軟件測評和各級部門評審的軟件在安全可靠性方面應該有一定的可信賴性。企業也可以向采用該會計軟件的其他企業進行咨詢。
二是會計軟件的打印模塊是否完整：這是許多企業在選擇會計軟件時常常忽略的一點，企業在使用后才發現會軟件并不能打印出企業所需要的特定部分。企業的會計資料最終都要打印出來并存檔。所以在選用會計軟件時應充分關注會計軟件打印的憑證、賬簿、報表是否完整，并符合企業的偏好能否按照企業的特殊要求進行打印等等。設計良好的打印模塊能為企業節省大量的紙張和打印時間，反之則使企業處于進退兩難的境地。因為在軟件開發過程中，打印模塊通常較難設計，許多會計軟件在這方面做的并不好，所以企業在購買前應該進行相關賬簿的模擬打印。
三是會計軟件選型決策前的模擬運行：這一點是企業選擇會計軟件時至關重要的一點。購買之前的模擬運行必不可少。只有通過模擬運行，才可以檢驗財務軟件各個方面是否在本企業可行，可擴展。
